NGS数据分析共2篇
做NGS数据分析还在手动敲命令?deepTools一套搞定ChIP-seq全流程,真的绝了🔥-Skill优仓

做NGS数据分析还在手动敲命令?deepTools一套搞定ChIP-seq全流程,真的绝了🔥

deepTools是专为高通量测序数据设计的Python命令行工具集,支持ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq等主流NGS实验类型。核心功能涵盖BAM转bigWig归一化覆盖轨迹、样本质控(plotFingerprint、plotCorre...
Skill优仓的头像-Skill优仓Skill优仓7天前
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基因组数据处理不再头疼!pysam读写BAM/VCF/FASTA真的太香了🧬🔥-Skill优仓

基因组数据处理不再头疼!pysam读写BAM/VCF/FASTA真的太香了🧬🔥

pysam是专为NGS数据处理设计的Python工具包,底层封装htslib,支持SAM/BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件、FASTA/FASTQ序列文件的高效读写操作,并可直接调用samtools和bcftools命令。适合生物...
Skill优仓的头像-Skill优仓Skill优仓7天前
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